Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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ITGB3BPQ13352 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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ITGB3BPQ13352 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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ITGB3BPQ13352 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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ITGB3BPQ13352 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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ITGB3BPQ13352 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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ITGB3BPQ13352 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.77
ITGB3BPQ13352 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
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ITGB3BPQ13352 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGB3BPQ13352 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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ITGB3BPQ13352 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGB3BPQ13352 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGB3BPQ13352 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGB3BPQ13352 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGB3BPQ13352 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGB3BPQ13352 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGB3BPQ13352 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGB3BPQ13352 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGB3BPQ13352 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGB3BPQ13352 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGB3BPQ13352 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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