Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM28Q13263 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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