Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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