Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPN13Q12923 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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