Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXO1Q12778 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms