Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TMPOP42166 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TMPOP42166 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TMPOP42166 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TMPOP42166 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TMPOP42166 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TMPOP42166 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TMPOP42166 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TMPOP42166 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
TMPOP42166 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TMPOP42166 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TMPOP42166 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TMPOP42166 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TMPOP42166 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TMPOP42166 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TMPOP42166 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TMPOP42166 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TMPOP42166 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TMPOP42166 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TMPOP42166 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TMPOP42166 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TMPOP42166 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TMPOP42166 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TMPOP42166 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TMPOP42166 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TMPOP42166 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TMPOP42166 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.4 ms