Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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