Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CSAG1Q6PB30 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms