Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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SGCAQ16586 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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