Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USF2Q15853 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USF2Q15853 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USF2Q15853 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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