Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms