Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms