Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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BRD3Q15059 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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BRD3Q15059 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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BRD3Q15059 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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BRD3Q15059 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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BRD3Q15059 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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BRD3Q15059 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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BRD3Q15059 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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BRD3Q15059 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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BRD3Q15059 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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BRD3Q15059 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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BRD3Q15059 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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BRD3Q15059 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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