Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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