Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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