Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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TCIRG1Q13488 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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TCIRG1Q13488 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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TCIRG1Q13488 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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TCIRG1Q13488 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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TCIRG1Q13488 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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TCIRG1Q13488 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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TCIRG1Q13488 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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TCIRG1Q13488 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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TCIRG1Q13488 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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