Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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