Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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GPS1Q13098 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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GPS1Q13098 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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GPS1Q13098 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GPS1Q13098 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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