Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 PTMAP1-205ENST00000455552 325 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
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