Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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