Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

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Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SCAPQ12770 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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