Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IRF9Q00978 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms