Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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HOXA13P31271 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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HOXA13P31271 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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HOXA13P31271 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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HOXA13P31271 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
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HOXA13P31271 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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