Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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