Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA2O43364 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms