Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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SH3BP1Q9Y3L3 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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SH3BP1Q9Y3L3 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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SH3BP1Q9Y3L3 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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SH3BP1Q9Y3L3 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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SH3BP1Q9Y3L3 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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SH3BP1Q9Y3L3 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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