Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CEP44Q9C0F1 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms