Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.7 ms