Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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LAMA3Q16787 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
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LAMA3Q16787 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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LAMA3Q16787 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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LAMA3Q16787 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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LAMA3Q16787 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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LAMA3Q16787 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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LAMA3Q16787 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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LAMA3Q16787 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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LAMA3Q16787 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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LAMA3Q16787 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
LAMA3Q16787 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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