Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NEUROD1Q13562 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms