Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.9 ms