Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms