Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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