Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LINC00587B1AMM8 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms