Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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FOXQ1Q9C009 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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FOXQ1Q9C009 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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FOXQ1Q9C009 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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FOXQ1Q9C009 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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FOXQ1Q9C009 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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FOXQ1Q9C009 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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FOXQ1Q9C009 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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FOXQ1Q9C009 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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FOXQ1Q9C009 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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FOXQ1Q9C009 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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