Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms