Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms