Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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DDX39BQ13838 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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DDX39BQ13838 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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DDX39BQ13838 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
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DDX39BQ13838 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
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DDX39BQ13838 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
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DDX39BQ13838 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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DDX39BQ13838 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
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