Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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CDH18Q13634 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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CDH18Q13634 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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