Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PRPF4BQ13523 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PRPF4BQ13523 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PRPF4BQ13523 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PRPF4BQ13523 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PRPF4BQ13523 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PRPF4BQ13523 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PRPF4BQ13523 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PRPF4BQ13523 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PRPF4BQ13523 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PRPF4BQ13523 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PRPF4BQ13523 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PRPF4BQ13523 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PRPF4BQ13523 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PRPF4BQ13523 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PRPF4BQ13523 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PRPF4BQ13523 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PRPF4BQ13523 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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