Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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