Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms