Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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CLN3Q13286 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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CLN3Q13286 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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