Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms