Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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