Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms