Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HOXD10P28358 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms