Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms