Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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ERVV-1B6SEH8 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
ERVV-1B6SEH8 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERVV-1B6SEH8 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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