Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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FOXQ1Q9C009 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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FOXQ1Q9C009 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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FOXQ1Q9C009 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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FOXQ1Q9C009 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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FOXQ1Q9C009 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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FOXQ1Q9C009 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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